本系的科学研究及人才培养侧重于生命科学与电子信息科学的交叉和渗透，综合应用电子信息科学技术，深入 研究生物体（尤其是人体）的结构、功能及其相互关系，解决生物医学领域中的有关问题，同时运用生物医学的最新 成果推动电子信息科学和技术的发展。在国内较早地开展了生物医学信号的获取和处理、生物医学图像的处理和重 建、纳米分子材料及其组装技术、分子电子器件、生物传感器和生物芯片、仿生计算原理和认知模型等方面的研究 工作。在某些领域的学术水平已处于国际先进行列。国际学术界交流活动广泛，已与美、日、德、英、法、加拿大 等国家的十几所大学和研究所建立了合作关系，包括联合培养博士研究生。目前主要研究内容包括脑科学及其应用、 生物医学信息处理、生物信息技术、纳米技术和功能材料。该系的实验设备先进精良,有分子与生物分子电子学教育 部重点实验室(吴健雄实验室)和医学影像与精确诊治技术研究中心,拥有先进的扫描隧道显微镜、原子力显微镜、纳 秒级时间分辨激光系统、激光共聚焦显微镜、DNA合成仪、计算机图形工作站等一批大型设备。
    1994年该系的“生物电子学”被江苏省评为首批省级重点学科，在历次省级重点学科评比中，均被评为优秀省级 重点学科。1997年吴健雄实验室参加并通过国家重点实验室的评估，同年学科经国务院学位委员会批准成为生物医学工程一级学科博士点，1998年该学科被批准设立博士后流动站，同年被教育部批准设立首批“长江学者奖励计划”特聘教授岗位。2000年吴健雄实验室被教育部核准为教育部重点实验室。2001年以陆祖宏教授为主的骨干研究群体 申报国家自然科学基金创新研究群体并通过答辩。国内外许多专家对该群体的多学科交叉的人才结构、前沿研究的创 新能力给予了高度评价。近5年来，承担国家九五攻关项目二项，国家自然科学基金重点、重大项目各1项，国家863高技术项目2项，973重点基础研究项目1项，国防科工委项目3项，省级项目36项。其中鉴定成果16项，获得部级二等 奖3项、三等奖3项，获发明专利10项，发表论文650篇，其中被SCI等收录298篇。授予博士学位32人（其中全国百篇 优秀博士论文获得者2名，省优秀博士论文获得者1名），硕士学位74人，进站博士后26人，博士生在校期间人均发表 论文11.3篇。